"En «Tratado de ateología», Onfray trata al mismo nivel a los tres monoteísmos dominantes: el cristianismo, el judaísmo y el islam, porque según el autor, «se parecen y tienen en común el odio hacia la mujer, hacia la razón, hacia la ciencia, la inteligencia y la libertad del cuerpo y el pensamiento»."
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Seguidor cercano de la filosofía de Nietzsche, no defiende como éste la idea de que Dios está muerto, sino que concluye que la idea de Dios, muy presente en la vida cotidiana, es una ficción inventada con efecto narcotizante para que el ser humano no busque respuestas. Declarado anarquista, Michel Onfray también reconoce el fracaso del ateísmo en algunos países y su crítica a los monoteísmos puede hacerse extensiva a algunas ideologías: «Se podría extender al comunismo, pero el comunismo ya no está de moda».

«Tratado de ateología» es un libro «contundente, higiénico y necesario», según las palabras de Jorge Herralde, editor de Anagrama, que lo ha elogiado sin titubeos calificándolo como un «vigoroso panfleto contra los monoteísmos».